澳门科学文化中心的博物馆致力于研究和传播中葡两国之间的关系。力争做到百花齐放,兼容并蓄。该博物馆由两个不同的互补核心组成:
第一个核心是“16、17世纪澳门的历史和文化状况”。它指的是中国明朝时期的国际氛围以及与港口城市澳门建立的跨文化边界的中欧文化。另还展示了一些关于澳门的历史和中葡关系史的研究成果。
博物馆的第二个核心是“中国艺术品的收藏”。其涵盖了超过5000年的历史和艺术,包括: